Koronavīrusi ir RNS vīrusi kas pieder pie coronaviridae dzimtas. Šie vīrusi uzrāda ievērojami augstu kļūdu līmeni replikācijas laikā, jo trūkst to polimerāžu korektūras nukleāzes aktivitātes. Citos organismos replikācijas kļūdas tiek izlabotas, bet koronavīrusiem šīs spējas trūkst. Rezultātā replikācijas kļūdas koronavīrusos paliek neizlabotas un uzkrājas, kas savukārt darbojas kā variāciju un adaptācijas avots šajos vīrusi. Tādējādi koronavīrusu genomu mutācijas vienmēr ir bijušas ārkārtīgi augstas; jo vairāk notiek pārraide, jo vairāk notiek replikācijas kļūdu un līdz ar to vairāk mutāciju genomā, kas izraisa vairāk varianti sekojoši.
Acīmredzot, mainot uz jaunu varianti nav jaunums koronavīrusi. Cilvēka koronavīrusi nesenajā vēsturē ir veidojušas mutācijas jaunām formām. Bija vairāki varianti atbildīgs par dažādām epidēmijām kopš 1966. gada, kad tika reģistrēta pirmā epizode.
SARS-CoV bija pirmais letālais variants, kas izraisīja korona vīruss epidēmija Ķīnas Guandunas provincē 2002. gadā. MERS-CoV bija nākamais svarīgais variants, kas 2012. gadā izraisīja epidēmiju Saūda Arābijā.
Novele korona vīruss SARS-CoV-2, variants, kas ir atbildīgs par pašreizējo COVID-19 pandēmiju, kas sākās 2019. gada decembrī Uhaņā, Ķīnā un pēc tam izplatījās visā pasaulē, kļūstot par pirmo korona vīruss pandēmija cilvēces vēsturē, ir nepārtraukti piedzīvojusi turpmāku adaptāciju, uzkrājot mutācijas dažādos ģeogrāfiskos reģionos, izraisot vairākus apakšpunktus.varianti. Šīs apakš-varianti ir nelielas atšķirības to genomā un smaiļu proteīnos, un tiem ir atšķirības to transmisijas ātrumā, virulenci un imūnsistēmas infekciozitāti.
Pamatojoties uz draudiem, ko šie apakšvarianti rada, tie ir sagrupēti trīs kategorijās – varianti bažas (GOS), Interesējošie varianti vai Varianti, kas tiek izmeklēti (VOI) un Varianti, kas tiek uzraudzīti. Šī apakšvariantu grupēšana ir balstīta uz pierādījumiem, kas saistīti ar infekcijas pārnēsājamību, imunitāti un smagumu.
- Varianti, kas rada bažas (GOS)
Problēmas variantiem (GOS) ir skaidra saistība ar jebkādu sabiedrības veselības pasākumu, piemēram, pašlaik izmantoto vakcīnu efektivitātes, pārnēsājamības vai virulences palielināšanos vai efektivitātes samazināšanos.
| PVO etiķete | ciltsraksti | Pirmā atklātā valsts (kopiena) | Pirmo reizi atklāts gads un mēnesis |
| Alfa | B.1.1.7 | Apvienotā Karaliste | septembris 2020 |
| beta | B.1.351 | Dienvidāfrika | septembris 2020 |
| Gamma | P.1 | Brazīlija | decembris 2020 |
| Delta | B.1.617.2 | Indija | decembris 2020 |
- Interesējošie varianti vai varianti, kas tiek izmeklēti (VOI)
Ir zināms, ka interesējošajiem variantiem vai pētāmajiem variantiem (VOI) ir ģenētiskas izmaiņas, kas var ietekmēt tā pārnēsāšanu, virulenci vai sabiedrības veselības pasākumu efektivitāti, un ir konstatēts, ka tie izraisa nozīmīgu pārnešanu sabiedrībā.
| PVO etiķete | ciltsraksti | Pirmā atklātā valsts (kopiena) | Pirmo reizi atklāts gads un mēnesis |
| Eta | B.1.525 | Nigērija | decembris 2020 |
| Iota | B.1.526 | ASV | 2020. novembris |
| Kappa | B.1.617.1 | Indija | decembris 2020 |
| Lambda | C.37 | Peru | decembris 2020 |
- Varianti tiek uzraudzīti
Uzraudzībā esošie varianti tiek atklāti kā signāli, un ir norādes, ka tiem var būt līdzīgas īpašības kā GOS, taču pierādījumi var būt vāji. Tādējādi šie varianti tiek pastāvīgi uzraudzīti, lai konstatētu jebkādas izmaiņas.
| PVO etiķete | ciltsraksti | Pirmā atklātā valsts (kopiena) | Pirmo reizi atklāts gads un mēnesis |
| B.1.617.3 | Indija | februāris 2021 | |
| A.23.1+E484K | Apvienotā Karaliste | decembris 2020 | |
| Lambda | C.37 | Peru | decembris 2020 |
| B.1.351+P384L | Dienvidāfrika | decembris 2020 | |
| B.1.1.7+L452R | Apvienotā Karaliste | janvāris 2021 | |
| B.1.1.7+S494P | Apvienotā Karaliste | janvāris 2021 | |
| C.36+L452R | Ēģipte | decembris 2020 | |
| AT.1 | Krievija | janvāris 2021 | |
| Iota | B.1.526 | ASV | decembris 2020 |
| Zeta | P.2 | Brazīlija | janvāris 2021 |
| AV.1 | Apvienotā Karaliste | marts 2021 | |
| P.1+P681H | Itālija | februāris 2021 | |
| B.1.671.2 + K417N | Apvienotā Karaliste | jūnijs 2021 |
Šī grupēšana ir dinamiska, kas nozīmē, ka apakšvarianti var tikt izņemti no vienas grupas vai iekļauti jebkurā grupā atkarībā no izmaiņām draudu novērtējumā attiecībā uz pārnesamību, imunitāti un infekcijas smagumu.
Ironiski, ka pašlaik šķiet, ka SAR-CoV-2 attīstība turpinās. Iet pēc būtības šī vīruss, kamēr notiek pārnešana starp cilvēkiem, būs replikācijas kļūdas un mutācijas. Daži mutanti vai varianti var pārvarēt atlases spiedienu, lai kļūtu infekciozāki un virulentāki, vai izvairīties no imūnās atbildes, lai padarītu vakcīnu mazāk efektīvu. Iespējams, augstākas pārraides reģionos ar laiku tiks atklāti daudz vairāk variantu. Pārraides samazināšana un pastāvīga uzraudzība ir ierobežošanas stratēģiju atslēga.
***
Avoti:
- Prasad U., 2021. Jauni SARS-CoV-2 celmi (the vīruss atbildīgs par COVID-19): vai “neitralizējošu antivielu” pieeja varētu būt atbilde uz ātrām mutācijām? Zinātniskais eiropietis. Publicēts 23. gada 2020. decembrī. Pieejams tiešsaistē vietnē http://scientificeuropean.co.uk/medicine/new-strains-of-sars-cov-2-the-virus-responsible-for-covid-19-could-neutralising-antibodies-approach-be-answer-to-rapid-mutation/
- PVO, 2021. SARS-CoV-2 variantu izsekošana. Pieejams tiešsaistē plkst https://www.who.int/en/activities/tracking-SARS-CoV-2-variants/
- ECDPC 2021. SARS-CoV-2 varianti, kas rada bažas 8. gada 2021. jūlijā. Pieejams tiešsaistē vietnē https://www.ecdc.europa.eu/en/covid-19/variants-concern
***
