Pārbaudes laiks ir ievērojami samazināts no aptuveni stundas līdz dažām minūtēm, izmantojot nesen ziņoto RTF-EXPAR metodi, kas izmanto bezreversās transkriptāzes (RTF) pieeju, lai pārveidotu RNS uz DNS kam seko EXPAR (eksponenciālā amplifikācijas reakcija) pastiprināšanai vienā temperatūrā.
Likmes kontrole Covid-19 izplatībai ir nepieciešama precīza un ātrāka vīrusu pārbaudes stratēģija. RT-PCR (reversās transkriptāzes polimerāzes ķēdes reakcija), precīzākā pašlaik izmantotā testēšanas metode ir divpakāpju tests, kas vienam paraugam aizņem apmēram 60 minūtes.
Birmingemas Universitātes pētnieki ir ziņojuši par jaunu metodi SARS-CoV-2 noteikšanai. Tas varētu nodrošināt daudz ātrāku testēšanu un ir pietiekami jutīgs.
Vīrusa RNS noteikšana ar RT-PCR (reversās transkriptāzes polimerāzes ķēdes reakcija) ietver vīrusa RNS pārvēršanu komplementārā DNS (cDNS), kam seko cDNS amplifikācija ar kvantitatīvu PCR (qPCR). Pēc tam cDNS nosaka, izmantojot fluorescējošu krāsu. Tas aizņem līdz stundai.
Pārbaudes laiks ir ievērojami samazināts no aptuveni stundas līdz dažām minūtēm, izmantojot nesen ziņoto RTF-EXPAR metodi, kas izmanto bezreversās transkriptāzes (RTF) pieeju RNS pārvēršanai par DNS kam seko EXPAR (eksponenciālā amplifikācijas reakcija) pastiprināšanai vienā temperatūrā. Pastiprināšana, kas notiek vienā temperatūrā, ir ātruma atslēga, jo tā ļauj izvairīties no ilgstošiem RT-PCR sildīšanas un dzesēšanas posmiem. Turklāt DNS daļa, kas tiek pastiprināta, ir mazāka, salīdzinot ar RT-PCR. Tādējādi EXPAR dažu minūšu laikā ģenerē līdz 108 DNS produkta virknēm. Dupleksa veidošanās tiek uzraudzīta, tāpat kā RT-PCR metodē, izmantojot fluorescējošu krāsu SYBR Green.
Interesanti, ka jauno metodi var modificēt, lai atklātu vairākas citas infekcijas slimības, ko izraisa RNS vīrusi, piemēram, Ebola, RSV u.c.
Avots (-i):
Kārters et al (2020). Zem 5 minūšu SARS-CoV-2 RNS noteikšana, izmantojot bezreversās transkriptāzes eksponenciālās amplifikācijas reakciju, RTF-EXPAR. Iepriekšēja drukāšana. Publicēts medRxiv Publicēts 04. gada 2021. janvārī. DOI: https://doi.org/10.1101/2020.12.31.20248236
***
