Kākāpō Parrot: Genomikas sekvencēšanas priekšrocības Saglabāšanas programma

Kākāpō papagailis (pazīstams arī kā “pūces papagailis ” tā pūcei līdzīgo sejas vaibstu dēļ) ir kritiski apdraudēta papagaiļu suga, kuras dzimtene ir Jaunzēlande . Tas ir neparasts dzīvnieks, jo ir pasaulē visilgāk dzīvojošais putns (var nodzīvot līdz 90 gadu vecumam). Ar svaru aptuveni 3–4 kg tas ir arī smagākais, vienīgais nelidojošais un nakts papagailis pasaulē.

Kākāpo papagaiļi apdzīvoja Jaunzēlandi kopš to izolētas evolūcijas , taču to populācija strauji samazinājās. 1970. gs. 1,2. gados bija zināms, ka pastāv tikai 18 kākāpo tēviņi. Kākāpo mātīšu eksistence tika apstiprināta 1980. gadā. Pateicoties intensīvai dabas aizsardzībai, Kākāpo papagaiļi ir izglābti no izmiršanas robežas. 1995. gadā to skaits bija 51. Mūsdienās dzīvi ir 247 ^kākāpo.

Lai palīdzētu saglabāt sugas, 2015. gadā tika uzsākts projekts Kākāpō125+, lai sekvencētu 125 dzīvu kākāpo, kā arī dažu svarīgu nesen mirušu īpatņu genomus. Ideja bija uzlabot kākāpo ģenētisko pārvaldību, jo īpaši, lai risinātu zemas reproduktīvās spējas (neauglības) un slimību problēmu, kas kavēja atveseļošanos. Pilnīga atsevišķa kākāpo atsauces genoma hromosomu līmeņa montāža tika pabeigta 2018. ^gadā3.

^{2023. gada 29.} augustā publicētā pētījumā pētnieku komanda ziņoja par gandrīz visas kākāpō populācijas (uz 2018. gadu), kas sastāvēja no 169 kākāpō īpatņiem, genomu sekvencēšanu no 125 dzīviem īpatņiem un 44 uzglabātiem paraugiem. Populācijas līmeņa dati saista ģenētisko daudzveidību sugās ar specifiskām DNS sekvencēm, kas saistītas ar tādām īpašībām kā slimību uzņēmība, cāļu augšana utt. Tas varētu palīdzēt agrāk identificēt veselības riskus, lai plānotu ārstēšanu, kas pielāgota katram kākāpō putnam. Šo pieeju, lai identificētu specifiskas ģenētiskās pazīmes, kas ir būtiskas izdzīvošanai, varētu izmantot arī citu apdraudēto sugu aizsardzības pārvaldībā4,5^.

*** 

Norādes:  

1. Dabas aizsardzības departaments. Jaunzēlandes valdība. Kākāpō Atveseļošanās. Pieejams plkst  https://www.doc.govt.nz/our-work/kakapo-recovery/ 

2. Dabas vēstures muzejs. Jaunzēlandes savdabīgie kākāpo ir izvilkti no izzušanas robežas. https://www.nhm.ac.uk/discover/new-zealands-quirky-kakapo-are-pulled-back-from-extinction.html 

3. Dabas aizsardzības departaments. Jaunzēlandes valdība. Kākāpō125+ gēnu sekvencēšana https://www.doc.govt.nz/our-work/kakapo-recovery/what-we-do/research-for-the-future/kakapo125-gene-sequencing/ 

4. Otago Universitāte, 2023. gads. Ziņas — sugu glābšana no izzušanas — augstas kvalitātes kākāpo populācijas secība nodrošina izrāvienu galveno saglabāšanas ģenētikas izpratnē. Pieejams plkst https://www.otago.ac.nz/news/otago0247128.html Skatīts 29. gada 2023. augustā.  

5. Guhlin, J., Le Lec, MF, Wold, J. et al. Kākāpō sugas mēroga genomika nodrošina rīkus, lai paātrinātu atveseļošanos. Nat Ecol Evol (2023). https://doi.org/10.1038/s41559-023-02165-y  Iepriekšēja drukāšana vietnē bioRxiv doi: https://doi.org/10.1101/2022.10.22.513130  

***